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Il en faut deux: le coronavirus COVID-19 peut-être `` chimère '' de deux virus distincts

Il en faut deux: le coronavirus COVID-19 peut-être `` chimère '' de deux virus distincts


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À l'ère du nouveau coronavirus, les semaines semblent être des années - surtout quand il y a tant à apprendre sur le COVID-19 et le virus derrière: le SRAS-CoV-2. Mais là où il y a danger, les rumeurs abondent.

Entre la science et les lacunes grises des inconnues repose la question de l'origine: d'où vient le coronavirus COVID-19 dans le monde? Une nouvelle étude suggère qu'il s'agit d'une chimère entre deux virus préexistants.

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Coronavirus COVID-10 d'origine inconnue

Parmi tous les animaux porteurs de la maladie, dans lesquels le COVID-19 est-il arrivé? Était-ce un pangolin, une chauve-souris ou une autre espèce sauvage? Cela aurait pu être une forêt ou une grotte; dans la province chinoise du Hubei, ou peut-être ailleurs.

En décembre 2019, 27 des 41 premières personnes hospitalisées (environ 66%) ont traversé un marché au cœur de la ville de Wuhan, dans la province chinoise du Hubei. Cependant, une étude menée à l'hôpital de Wuhan montre que le premier cas humain identifié n'a pas fréquenté ce marché.

Au contraire, une estimation de datation moléculaire basée sur les séquences génomiques du SRAS-CoV-2 suggère une origine de novembre. Cela soulève de sérieuses questions sur le lien entre la faune et l'épidémie de COVID-19.

Données génomiques

Des chercheurs chinois ont rapidement séquencé les données génomiques du SRAS-CoV-2. La molécule d'ARN est constituée d'environ 30 000 bases contenant 15 gènes, dont le redouté gène S qui code pour une protéine située à la surface de l'enveloppe virale. En revanche, comparez avec le génome humain, qui prend la forme d'une double hélice d'ADN d'environ 3 milliards de bases et contenant environ 30 000 gènes.

Des analyses comparatives des génomes montrent que le génome du SRAS-CoV-2 appartient à la Bétacoronavirus groupe, très proche du SRAS-CoV responsable de l'épidémie de pneumonie aiguë qui s'est manifestée dans la province chinoise du Guangdong en novembre 2002, balayant 29 pays en 2003.

Au total, 8 098 cas de SRAS-CoV, avec 774 décès. On sait que les chauves-souris du genre Rhinolophus (qui pourraient vivre dans des grottes) étaient le réservoir de ce virus et qu'un petit carnivore appelait la civette des palmiers (Paguma larvata) pourrait avoir joué le rôle d'hôte intermédiaire entre les chauves-souris et les premiers cas humains de SRAS.

Depuis ce temps, la plupartBétacoronavirus ont été découverts chez les chauves-souris, mais aussi chez l'homme. Par exemple, une autre souche connue sous le nom de RaTG13 a été isolée d'une chauve-souris duRhinolophus affinis des espèces de la province chinoise du Yunnan, décrites comme notablement similaires au SRAS-CoV-2, avec une similitude de 96% dans la séquence du génome; presque identique.

Cela signifie les chauves-souris (en particulier les espèces deRhinolophus genre) sont le «réservoir» des virus SARS-CoV et SARS-CoV-2.

Réservoir d'ambiguïté

Le problème réside dans ce que nous entendons par «réservoir». En épidémiologie, un réservoir est une ou plusieurs espèces animales peu ou pas sensibles au virus, ce qui signifie qu'elles servent d'hôtes naturels (ou neutres) à un ou plusieurs virus.

Cette absence de symptômes s'explique par l'efficacité du système immunitaire de l'hôte, qui l'aide à lutter contre une prolifération virale excessive.

Mécanisme de recombinaison

Une étude récente (en cours d'examen) montre un génome du coronavirus isolé du pangolin malais - appeléManis javanica - est encore moins similaire au SRAS-CoV-2, avec seulement 90% de chevauchement génomique. Cela signifierait que le virus isolé dans les pangolins n'est pas responsable de la pandémie COVID-19 qui ravage actuellement le monde.

Cependant, le coronavirus isolé du pangolin présente une incroyable similitude de 99% spécifique à la région de la protéine S, correspondant à 74 acides aminés liés au domaine de liaison au récepteur ACE (Angiotensin Converting Enzyme 2); celui avec lequel le virus pénètre dans les cellules humaines pour les infecter.

Contrairement à cela, le virus RaTG13 isolé duR. affinis chauve-souris diverge significativement de cette région spécifique (similitude d'environ 77%, nettement inférieure). Cela signifie que le coronavirus isolé du pangolin peut pénétrer dans les cellules humaines, mais celui duR. affinis chauve-souris ne peut pas.

De plus, cette analyse comparative approfondie suggère que le virus SARS-CoV-2 est la création d'une recombinaison entre deux virus séparés et distincts - l'un proche de RaTG13 et l'autre plus proche du virus isolé dans le pangolin.

En termes simples, le coronavirus COVID-19 est une chimère entre deux autres virus préexistants. Pour que cela se produise, deux virus distincts doivent infecter le même organisme simultanément. Bien que nous ne sachions pas quel animal (un pangolin, une chauve-souris ou une autre espèce) a accueilli le mélange chimérique, ni dans quelles conditions la recombinaison a eu lieu, nous nous rapprochons progressivement de la résolution du mystère de l'endroit et comment le nouveau coronavirus est né.


Voir la vidéo: Covid: entre connaissances et inconnues (Janvier 2023).